Die Hundephysiotherapie orientiert sich bei der Behandlung an den Beschwerden und Funktions-, Bewegungs- bzw. Aktivitätseinschränkungen des Hundepatienten, welche bei der physiotherapeutischen Untersuchung diesseits festgestellt werden.
Außerdem empfiehlt sich nach Operationen , besonders am Bewegungsapparat, den Hund zu behandeln um ihn schonend in die Bewegung zurückzuführen und einer Verkürzung der Bänder und Muskeln durch langes Pausieren und Liegen vorzubeugen.